基于并行化诱导排序快速实现Burrows-Wheeler 变换算法

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摘要:为解决生物序列比对算法中主流索引技术Burrows-Wheeler变换(BWT) 构建索引效率低的问题,文章提出了一种利用并行化诱导排序改进BWT索引构建的方法。首先,该研究充分发挥诱导排序的线性时间复杂度优势,高效地建立后缀数组。其次,基于此,采用并行化优化算法对后缀类型和子串处理过程进行优化。(剩余158字)

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