序列比对算法BWA的优化

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摘 要:序列比对是基因组数据分析的关键一环,提高其比对效率对推动测序技术在医学、古生物学等领域的应用具有重要意义。针对BWA算法两大步骤之一的SAMSE存在冗余读取索引导致效率欠佳的问题,提出了新的算法BWA*。其通过运用流程优化消除了SAMSE中参考序列及其索引的冗余读取,在此基础上叠加运用关键参数值调整和多线程优化等技术,进一步提高了计算效率。(剩余25363字)

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