基于贪心策略的多毒株病毒全长参考基因组组装算法

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摘要：病毒基因组具有高度遗传异质性，传统组装方法的拼装结果存在片段化问题。为此，提出了一种基于贪心策略的方法（RK-Virus），通过k-mer提取、选取种子、序列扩展等步骤构建全长参考基因组。实验结果表明，RK-Virus拼装出的Contig数量始终为1，解决了现有算法的片段化问题，在两个数据集上每100 kbp的错误数平均减少了25.2%。（剩余11586字）

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