基于转录组分析的甘薯贮藏根淀粉含量相关SNPs开发

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摘要：甘薯是重要的粮食和经济作物，贮藏根淀粉含量是甘薯的重要农艺性状，开发与淀粉含量相关的分子标记对于加快育种进程具有重要意义。但甘薯具有自交不亲和特性，基因组是高度杂合的六倍体，增加了开发分子标记的难度。本试验以高淀粉品种漯徐薯8号和低淀粉品种郑薯20及其杂交F1代中6个高淀粉株系和6个低淀粉株系为材料，基于转录组测序分析并结合表型分析，发现44个高淀粉特异的SNPs位点，从中选取9个进行PCR单克隆分析，筛选到3个与高淀粉含量显著相关的位点，分别为chr9.27120209、chr9.27120256和chr9.13675504，用上述12个株系和F1群体中的另外16个株系进行验证，最终得到3个与贮藏根淀粉含量相关的单核苷酸多态性（SNPs）位点。（剩余4427字）