江西铅山红芽芋TIFY 9基因克隆与功能分析

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摘要:为了深入探究江西铅山红芽芋TIFY 9基因的功能,通过江西铅山红芽芋试管苗转录组数据库筛选到江西铅山红芽芋TIFY 9基因的核心片段,利用RT-PCR 技术克隆该基因,并采用生物信息学方法、转基因瞬时表达和实时定量 PCR进行序列分析、亚细胞定位、器官表达分析和功能分析。结果表明:江西铅山红芽芋TIFY 9基因cDNA总长度为522 bp,G+C 含量为58.62%;由174个氨基酸组成,分子量19 073.87 u,等电点9.30,为亲水性蛋白;二级结构由α-螺旋(31.61%)、β-片层(12.64%)、无规则卷曲(55.75%) 构成,三级结构为单体;主要存在细胞核中;在进化上与Colocasia esculenta(芋)的亲缘关系较近,与Colocasia esculenta(芋)hypothetical protein Taro_030839(MQL98131.1)在进化上具有最高的亲缘关系。(剩余11551字)

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