不同单细胞全基因组扩增体系扩增牛微量血液DNA效果评价

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摘 要：  旨在通过二代测序技术评估不同单细胞全基因组扩增（single cell whole genome amplification， scWGA）体系对牛微量血液基因组DNA的扩增效果，建立微量DNA全基因组扩增体系。本研究分别采用MDA（multiple displacement amplification）和MALBAC（multiple annealing and looping-based amplification cycles）两种scWGA体系对华西牛1 ng血液基因组DNA进行全基因组扩增，随后基于两种体系的扩增产物以及原始未稀释血液DNA构建测序文库，利用DNBSEQ-T7RS测序平台进行全基因组测序（whole genome sequencing，WGS），通过比较扩增产物片段大小、浓度、总质量评估扩增效率，通过分析GC含量、测序覆盖度、基因分型一致率、基因型检出率等评估两种体系的扩增效果。（剩余18648字）