甘薯U6启动子克隆及其转录活性分析

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摘要： 在CRISPR/Cas9基因编辑系统中，U6启动子可以通过驱动sgRNA的表达来编辑目的基因，因而其转录活性会影响基因编辑效率。尽管人们已经在拟南芥、玉米、大豆、棉花等植物中开展了U6启动子的克隆与应用研究，然而目前在甘薯中U6启动子的相关研究还未见报道。本研究利用拟南芥的AtU6 SnRNA的保守序列在三浅裂野牵牛（Ipomoea trifida）基因组数据库中搜索候选U6 RNA，然后在其上游搜索到2个不同的候选U6启动子，长度分别为526 bp（IbU6p-1）和532 bp（IbU6p-2）；序列比对分析结果显示，甘薯的U6启动子具有上游序列元件（USE）以及TATA-box，其序列也与拟南芥高度相似。（剩余12995字）