基于滇黄精转录组序列的SSR标记开发及其在黄精属资源分析中的应用

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摘要:本研究基于滇黄精转录组序列开发简单重复序列(SSR)标记并将其应用于黄精属资源分析。设计合成了45对SSR引物,经PCR扩增验证,选择其中20对SSR引物对75份黄精属资源进行分析。结果表明,共在46 416个Unigene中检出含有二核苷酸~六核苷酸重复类型的SSR位点60 238个,序列SSR发生频率为22.78%,平均分布距离约7.07 kb;SSR位点中的主导类型是二核苷酸和三核苷酸重复,分别占50.06%和34.89%。(剩余15179字)

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