‘银辉’紫薇叶绿体基因组密码子偏好性分析 

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摘要：为探究紫薇品种‘银辉’叶绿体基因组特征、密码子使用模式及影响因素，采用高通量测序技术对‘银辉’紫薇叶绿体基因组测序，筛选出47条蛋白质编码序列进行密码子偏好性分析。结果显示：‘银辉’紫薇叶绿体基因组为典型的四分体结构，总长度为152 174 bp，GC含量为37.6%；基因组的有效密码子数（ENC）为35.73～61.00，密码子适应指数（CAI）为0.55～0.65，表明‘银辉’紫薇叶绿体基因组密码子偏好性较弱；基因组的最优密码子有11个（AAU、ACA、AGA、AGU、CAU、CGA、CUU、GGA、UAU、UUG和UUU），表明‘银辉’紫薇叶绿体基因组的密码子偏好以A或U结尾；中性绘图的回归系数为0.261 6，

且有效密码子绘图显示实际ENC和理论ENC差异较大，表明自然选择是影响密码子偏好性的主要因素。（剩余11756字）