不同芯片密度对华西牛重要经济性状基因组评估准确性的影响

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摘 要:
旨在基于Illumina BovineHD 770K与Cattle 110K芯片在华西牛中的实际应用情况,系统比较在不同标记密度下基因组选择预测准确性的差异,探索两款芯片在华西牛遗传评估中结合使用方法。本试验以课题组前期构建的华西牛基因组选择参考群体为研究对象,利用重测序数据将3 948头华西牛770K芯片填充至790K后,分别取90K(两款芯片交集)、110K、770K、790K(两款芯片并集)4种标记密度,对华西牛遗传评估所涉及的5个性状(断奶重、育肥期平均日增重、产犊难易度、胴体重、屠宰率)进行遗传力估计,并通过GBLUP模型利用五折交叉验证对基因组评估准确性进行比较,筛选并确定华西牛遗传评估中最适标记密度。(剩余23010字)