转录组测序筛选牛卵泡发育偏差和优势卵泡选择相关基因

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摘 要: 旨在筛选牛卵泡发育偏差和优势卵泡(dominant follicle, DF)选择相关基因。本研究选取6头10月龄健康海福特青年母牛,同期发情后平均分为两组,第一组采集第一个卵泡发育波出现偏差前第一大卵泡(the largest follicle at predeviation, PDF1)和第二大卵泡(the second largest follicle at predeviation, PDF2),第二组采集第一个卵泡发育波出现偏差后第一大卵泡(the largest follicle at onset of deviation, ODF1)和第二大卵泡(the second largest follicle at onset of deviation, ODF2),提取卵泡颗粒细胞(granule cells, GCs)RNA进行转录组测序,测序结果对照参考基因组,PDF1-VS-PDF2组筛选影响卵泡发育偏差的差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs),ODF1-VS-ODF2组、ODF1-VS-PDF1组和ODF1-VS-PDF2组筛选影响优势卵泡选择的DEGs并进行GO和KEGG富集分析、PPI分析筛选关键基因,通过RT-qPCR和Western blotting验证筛选基因的准确性。(剩余20794字)