法螺线粒体全基因组密码子偏好性分析

打开文本图片集

摘要：【目的】分析法螺（Charonia tritonis）线粒体基因组密码子偏好性，探究基因突变和自然选择对密码子偏好性的影响，为法螺属动物类群的系统发育树构建及种质资源保护与遗传改良提供参考依据。【方法】以法螺线粒体全基因组序列为材料，选择以ATG为起始密码子的非重复且长度大于300 bp的11个CDS（Coding DNA sequence）序列，采用CodonW 1.4.2进行密码子偏好性分析，并根据相对使用度差值（△RSCU）>0.08且RSCU在高表达基因库中>1.00的标准筛选出最优密码子。（剩余20523字）