草酸乙酰化降解途径酶基因密码子偏好性分析

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摘要:【目的】分析100种植物中参与草酸乙酰化降解途径的草酰-CoA合成酶(AAE3)、草酰-CoA脱羧酶(OCD)和甲酸脱氢酶(FDH)基因的密码子偏好性及其影响因素,并分析其适配的异源表达受体,为揭示AAE3、OCD和FDH基因在植物中的遗传修饰和进化规律及提高其异源表达效率提供理论依据。【方法】运用CodonW 1.4.2、CUSP及Python等软件工具,通过PR2-plot分析、ENC-plot分析、相对同义密码子使用量(RSCU)分析、中性绘图分析及密码子使用频率比较分析,深入解析AAE3、OCD和FDH基因编码区(CDS)序列的碱基组成特征、密码子偏好及其主要影响因素、高频密码子、最优密码子及异源表达适配受体。(剩余25823字)