木豆OFP蛋白基因家族鉴定与表达分析

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摘要:了解OFP卵型家族蛋白(OVATE family proteins)在木豆中的特征,为木豆OFP基因的应用提供参考。利用生物信息学方法对木豆OFP蛋白基因进行全基因组鉴定及表达模式分析。结果表明,木豆含有21个OFP蛋白基因,家族成员间理化特性差异不大,均属于不稳定亲水性蛋白,且均含有保守基序;进化树分析中木豆和拟南芥二者的OFP蛋白相互交错聚类在一起,亲缘关系较近的OFP蛋白可能具有相似的功能;启动子顺式响应元件分析表明木豆OFP基因可能在逆境胁迫响应、激素调节和生长发育方面发挥重要作用;蛋白二级和三级结构均以α-螺旋和无规则卷曲结构为主要组成成分;组织特异性表达表明OFP基因在顶芽中的表达量较大,在根和叶中的表达量较小,具有组织表达差异;启动子顺式响应元件结合热胁迫表达分析表明,高温胁迫下CcOFP1表达量上调,CcOFP9、CcOFP11表达量下调。(剩余12497字)