基于简化基因组测序评估小骨山羊群体遗传多样性和群体结构

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摘 要： 旨在分析小骨山羊群体的遗传多样性，为明确其是否为新种质资源提供理论依据。本研究以小骨山羊、河西绒山羊和内蒙古绒山羊（阿尔巴斯型）为研究对象，每个群体选取20只成年健康母羊，使用SLAF-seq技术检测全基因组范围内核苷酸多态性（SNPs）。遗传多样性通过使用perl编程计算次要等位基因频率（MAF）、观测杂合度（Ho）、期望杂合度（He）、基因多样性指数（Nei）、多态信息含量（PIC）和香浓维纳指数（SHI）；使用PopLDdecay进行连锁不平衡分析（LD）；使用VCFtools计算群体分化指数（Fst）。（剩余17693字）