基于SSR 标记分析浙西南香椿天然居群的遗传多样性

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摘 要:【目的】科学保护和合理利用香椿天然遗传资源,揭示浙西南香椿天然群体的分子遗传背景。【方法】利用16 个多态性SSR 标记对浙西南5 个香椿天然居群的156 份香椿材料进行遗传多样性、遗传分化程度和遗传结构分析。【结果】1)156 份香椿材料在16 个SSR 位点共检测出110 个等位基因,每个位点的平均等位基因数(Na)和平均有效等位基因数(Ne)分别为6.88 和2.48,不同等位基因在香椿个体中呈不均匀分布;16 个SSR 位点的多态性信息含量(PIC)介于0.04 ~ 0.79,平均为0.45;2)16 个SSR 位点的Shannon’s 信息指数(I)和Nei’s基因多样性指数(H)平均值分别为0.99 和0.49;居群内近交系数(Fis)和总近交系数(Fit)平均值分别为-0.02和0.03,遗传分化系数(Fst)平均值为0.05,仅5% 的遗传变异来自不同居群间;基因流(Nm)平均值为4.82;分子方差(AMOVA)分析显示遗传分化的根本原因为总的个体内变异(95%),极少为居群间变异(5%),没有来自居群内的个体变异;3)遗传差异和UPGMA 聚类分析表明5 个居群的Nei’s 基因遗传一致度为0.93。(剩余376字)

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