产灵菌红素沙雷氏菌R18的鉴定及基因组特性

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摘要：采用形态学、生理生化和分子生物学方法对菌株R18进行菌种鉴定。通过基因组测序和生物信息学比较，进一步分析其分类地位和生物学特性，并在基因组水平上探讨该菌株红色素的合成基因簇和代谢路径。结果表明：菌株R18最佳生长条件为温度30～37 ℃，pH值6～8，NaCl质量浓度0～10 g·L-1；菌株R18与粘质沙雷氏菌模式菌株ATCC 13880的16S rDNA相似度为99.86%，基因组平均核苷酸均一性和数字DNA-DNA杂交值分别为98.73%，89.5%，均高于物种界定阈值，属于同一个物种；菌株R18灵菌红素合成基因簇全长35 021 bp，包含29个基因，其中，4个核心合成基因、10个补充的合成基因、1个调控基因、1个转运基因及13个其他基因，具有完整的灵菌红素合成代谢途径。（剩余17096字）