基于泛基因组学和消减蛋白质组学技术筛选金黄色葡萄球菌基于泛基因组学和消减蛋白质组学技术筛选金黄色葡萄球菌

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[摘 要] 目的:应用泛基因组学和消减蛋白质组学技术从金黄色葡萄球菌基因组中筛选新抗菌靶点,为抗金黄色葡萄球菌药物的研发奠定基础。方法:在美国国家生物技术信息中心 (NCBI) 数据库中以金黄色葡萄球菌为关键词检索全基因组测序数据,收集50 个测序级别为Complete 的菌株基因组数据。采用BPGA 工具对基因组数据进行泛基因组分析获得金黄色葡萄球菌核心基因,采用消减蛋白质组学技术从中筛选获得潜在抗菌靶点, 以潜在抗菌靶点为受体, 采用LibDock 软件从美国食品药品监督管理局(FDA) 批准的药物库中筛选潜在的抗金黄色葡萄球菌药物,并采用分子对接技术分析药物和靶点的结合能力。(剩余12961字)

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