心房颤动患者人成纤维细胞的单细胞RNA序列的生物信息学分析

打开文本图片集
[摘要] 目的 筛选心房颤动(atrial fibrillation,AF)促纤维化的关键基因及信号通路,探讨AF诱导的人心房成纤维细胞的促纤维化重塑的分子机制。方法 从公共基因数据库(gene expression omnibus,GEO)下载单细胞RNA序列表达谱GSE148506,通过主成分分析和T分布式随机邻接嵌入得到差异基因,利用SingleR软件包进行细胞类型注释和轨迹分析,使用clusterprofiler软件包,对成纤维细胞的差异基因进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genome,KEGG)信号通路分析。(剩余8915字)