空间解析单细胞转录组的优化算法研究

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摘要：由于单细胞和空间转录组技术都存在一定的不足，整合单细胞转录组和空间转录组技术应运而生。为提高单细胞矩阵到空间矩阵映射的相似度，降低损失函数值，通过改进深度学习Tangram 算法的目标函数，同时受龙格库塔方法的启发对优化算法Adam 的梯度值进行修正，开发了RK-Tangram 算法。将其应用到3 组模拟数据与真实的小鼠大脑皮质、运动和视觉区域的数据上，与原始Tangram 算法相比，结果表明，RK-Tangram 算法不仅提高了映射的相似度，降低了损失函数值，而且扩展了空间转录组的全基因组图谱，并纠正了低质量的空间测量。（剩余1411字）