疏柔毛罗勒精油累积关键MYB的鉴定与挖掘
摘 要:MYB是植物中最大的转录因子家族之一,广泛参与植物生长发育、信号传导和次生代谢调控等过程。本研究基于疏柔毛罗勒2+3转录组数据,通过生信手段系统鉴定疏柔毛罗勒的MYB(ObMYB)家族并挖掘与精油累积相关的成员。首先,通过MYB保守结构域同源比对筛选ObMYB家族成员,预测其完整的开发阅读框并分析其基本理化性质;采用MEGA 7.0软件通过邻接法构建系统进化树,结合MEME、Batch CD-Search软件解析蛋白保守结构域特征;随后,结合前期疏柔毛罗勒miRNA组学数据,通过TargetFinder软件预测与ObMYB基因互补的靶向miRNA;最后,运用TBtools软件进行基因差异表达与热图可视化分析,基于茎叶不同发育期的精油数据,通过SPSS 25软件进行差异基因表达量与精油含量的相关性分析,筛选可能参与精油合成累积的关键ObMYB,并利用STRING数据库构建其蛋白互作(PPI)网络以解析可能参与的代谢通路。(剩余24106字)