基于转录组测序的剑白香猪表皮颜色相关miRNA筛选与鉴定

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摘要:【目的】对剑白香猪黑色和白色表皮组织进行转录组测序,筛选出对黑色素生成起调节作用的miRNA,为进一步研究miRNA对剑白香猪表皮颜色形成的调控机制提供理论依据。【方法】以剑白香猪黑色和白色表皮组织为 试验材料进行转录组测序,以|logFold Change|≥1且错误发现率(FDR)<0.05为标准,采用DESeq2筛选差异表达 miRNA,使用miRanda和RNAhybrid预测差异表达miRNA靶基因并进行GO功能注释和KEGG信号通路富集分析,构 建差异表达miRNA、靶基因和KEGG信号通路互作网络,利用实时荧光定量PCR对转录组测序结果进行验证。(剩余24280字)

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