3种贵州地方鸡盲肠菌群结构特征的比较

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摘要：【目的】基于微生物16S rRNA测序技术探究3种贵州地方鸡的盲肠菌群结构特征，鉴别不同品种鸡盲肠富集的特定菌群，从肠道菌群角度解析地方鸡遗传资源特性，进而加深对贵州地方鸡肠道菌群特征的认识。【方法】选取3种贵州地方鸡（乌蒙乌骨鸡11羽、黔东南小香鸡12羽及瑶山鸡12羽），采集盲肠内容物样品检测16S rRNA序列V3～V4可变区，通过QIIME计算鸡盲肠菌群Alpha多样性，以主坐标分析（PCoA）评估鸡盲肠菌群Beta多样性；采用SparCC算法构建盲肠菌群互作网络，使用马修斯相关系数（MCC）算法进行枢纽菌群识别，并以LEfse分析鉴别组间差异的菌群类别及功能通路。（剩余28308字）