基于生物信息学探究帕金森病miRNA-mRNA调控网络及作用机制

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［摘要］  目的： 通过生物信息学分析及临床试验，研究帕金森病（Parkinson′s disease，PD）发病过程中关键的miRNA及mRNA，识别具有诊断和治疗潜力的mRNA与miRNA。方法： 使用来自帕金森进展标志物计划（Parkinson′s progression markers initiative，PPMI）的mRNA和miRNA测序数据，分析两者的差异表达基因，通过机器学习确定关键miRNA，使用多个miRNA-mRNA互作数据库数据预测靶基因，再将预测的靶基因与差异表达mRNAs进行交叉匹配，获得miRNA-mRNA调控网络；然后利用STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白质相互作用（PPI）网络，并筛选出Hub基因；最后通过实时荧光定量PCR（qRT-PCR）在临床样本中对识别出的Hub基因和miRNA进行验证。（剩余12485字）