基于单细胞测序探究去势抵抗性前列腺癌肿瘤微环境及细胞间通讯相关信号分子

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[摘要]目的:探究去势抵抗性前列腺癌(castration-resistant prostate cancer,CRPC)的肿瘤微环境中相关信号分子,并分析其与肿瘤发生发展之间的关系。方法:通过基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中CRPC患者的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据(GSE137829),分析CRPC肿瘤微环境的主要组成成分;通过CellPhoneDB分析微环境中不同细胞间的相互作用,重点揭示肿瘤相关成纤维细胞(cancer-associated fibroblasts,CAFs)与恶性上皮细胞之间的联系;应用CellChat分析CAFs与恶性上皮细胞通讯相关的信号分子,结合肿瘤基因组图谱前列腺癌(TCGA-PRAD)的数据,寻找与CRPC患者预后密切相关的信号分子。(剩余18170字)