鲫鱼血液、肝脏、卵巢组织转录组比较分析

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摘要:为进一步丰富鲫鱼基因组数据,对肝脏、血液和卵巢组织进行高通量转录组测序。采用Illumina Hiseq高通量测序平台进行转录组测序,对所获得序列进行比对、基因注释、差异表达和SNP、SSR分析。结果提示,组装得到 127 801 条unigene,平均长度为735 bp。与相应数据库比对,最终获得117 414(91.87%)个有注释信息的unigene,有105条unigene获得GO注释,并分类到生物学过程、细胞组分和分子功能三大类42个功能中;有20 725条unigene被归纳到KOG的26个直系同源功能类型;获得KEGG注释的unigene共参与五大类32小类代谢通路。(剩余12813字)