棉花SOD基因家族生物信息学分析

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摘要：研究基于镉胁迫下棉花幼苗根系的转录组测序数据，鉴定获得16个棉花SOD基因，并对其进行生物信息学分析。结果表明：16个棉花SOD基因编码的蛋白长度为127～333 aa，相对分子质量为13 048.69～35 974.31 Da，等电点为4.43～8.50，均为非分泌蛋白，且都无跨膜结构特征，表现为亲水性；其中75%属于酸性蛋白，69%属于稳定蛋白；大部分亚细胞定位在叶绿体；16个棉花SOD可分为Fe-SOD、Mn-SOD和Cu/Zn-SOD 3个亚家族，3个亚家族均含有各自的保守基序，其中Fe-SOD和Mn-SOD亚家族亲缘关系较近，推测两者功能更相似。（剩余7597字）