基于幽门螺杆菌hp0169 基因三维结构的生物信息学分析

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[摘 要] 目的:克隆幽门螺杆菌 (Hp) hp0169基因并进行晶体学研究,分析其二级结构和三维结构。方法:由UniProt数据库中检索Hp NCTC26695菌株hp0169基因及其编码蛋白序列,采用生物信息学方法分析Hp 重组胶原蛋白酶(HpPrtC) 蛋白理化性质,SOPMA 和DNAStrar 软件预测HpPrtC蛋白二级结构特征, SWISS-MOPEL 软件构建HpPrtC 蛋白三维结构, IEDB 和ABCpred 软件预测HpPrtC 蛋白B 淋巴细胞抗原表位,SYFPEITHI 网站预测T 淋巴细胞抗原表位,专家库(EP) 算法和随机森林(RF) 算法预测HpPrtC 蛋白可结晶性。(剩余11417字)

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