基于高通量测序的北柴胡根转录组SSR位点信息分析

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摘 要 以北柴胡根为试材，采用高通量转录组测序方法，获得uingene序列信息，研究分析SSR分布、基元特征，设计、验证EST-SSR引物的有效性，为开发、丰富EST-SSR分子标记奠定基础。结果表明：从北柴胡根转录组中共筛选到31 176个SSR位点，分布于21 732条unigenes，出现的频率为20.08%，分布密度为3.20个/10 kb，主要重复基元类型以二核苷酸最为丰富，共21 056个，占SSR位点总数的67.54%；其次是单核苷酸和三核苷酸，分别占总SSR的19.05%和12.07%；四核苷酸～六核苷酸重复基元数量均较少。（剩余17091字）