基于COI 基因的浙江省内黄缘闭壳龟遗传多样性研究

打开文本图片集

摘 要 为了解浙江省内不同黄缘闭壳龟（Cuora flavomarginata）群体的种质资源现状，基于线粒体DNA COI序列对来自浙江省内野外和养殖场的8个黄缘闭壳龟群体的遗传多样性和遗传结构进行比较分析。结果表明：黄缘闭壳龟线粒体COI基因序列长度为1 040 bp，A=27. 4%、T=30. 5%、C=24. 6%、G=17. 5%，有较强的AT偏好性；共定义9 个单倍型，单倍型多样性（Hd）为（0. 799 00±0. 210 00），核苷酸多样性（Pi）为（0. 002 09±0. 001 47），呈“高Hd低Pi”遗传分布；不同黄缘闭壳龟群体间的遗传距离为0～0. 003，群体内部的遗传距离为0～0. 004，其中磐安后阁村（YS）群体内部的遗传距离最大，为0. 004；单倍型系统发育树并未呈现明显的谱系结构；群体间遗传分化指数（FST）为-0. 347 52～0. 822 22，8 个群体的遗传分化不显著（p>0. 05）；中性检验（Tajima’s D=-0. 366 27，Fu’s FS=-0. 605）与核苷酸错配分布均表明，浙江省内黄缘闭壳龟群体并未经历种群扩张事件，同时，由Mantel检验可知，遗传距离与地理距离没有显著的相关性（R=0. 293 8，p>0. 05）；AMOVA分子方差结果显示，群体内的遗传变异高于群体间（85. 06%>14. 94%）。（剩余17065字）