巴西橡胶树HbPP2基因家族鉴定与表达分析

打开文本图片集

摘  要：橡胶树胶乳代谢过程受到多种机制调控，其中泛素化修饰调控最为显著。韧皮部蛋白PP2属于F-box蛋白家族，在胶乳中特异性高表达，可能参与了胶乳再生调控。本研究对巴西橡胶树基因组中鉴定到的17个F-box成员HbPP2基因进行生物信息学和表达模式分析，结果表明：橡胶树PP2基因编码的蛋白大多数为不稳定亲水性蛋白，分子量介于9.402～61.206 kDa之间；系统进化分析表明巴西橡胶树中的17个HbPP2基因可以分为3个亚组（Ⅰ亚组，Ⅱ亚组和Ⅲ亚组），其中HbPP2成员在Ⅰ亚组中完全缺失；顺式作用元件分析发现，PP2基因启动子区域包含生长发育调控、激素响应和光响应等多种顺势作用元件；亚细胞定位预测发现，PP2蛋白主要定位在叶绿体或细胞质中；表达分析显示，橡胶树HbPP2家族中除部分成员具有组织表达特异性外，多数成员在各个组织中均有表达，在胶乳中，HbPP2-B1、HbPP2-B1.1、HbPP2-B10.1、HbPP2-A13.2、HbPP2-B13和HbPP2-A15.1的表达丰度较高，但割胶处理只显著上调HbPP2-A13.2和HbPP2-B13的表达。（剩余18259字）