三峡库区消落带水桦水淹胁迫下差异表达基因及关键代谢通路分析

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摘要:【目的】分析三峡库区消落带水桦在水淹胁迫下的差异表达基因(DEGs)及关键代谢通路,为阐明水桦抗水淹胁迫的分子机制及消落带苗木选育提供理论依据。【方法]以三峡库区消落带(万州段)栽培的水桦为试验材料,采集水淹约70和200d的枝条(分别标记为FB70d和FB200d)和根系(分别标记为FR70d和FR200d),并以同期未被水淹的枝条(分别标记为CB70d和CB200d)和根系(分别标记为CR70d和CR200d)为对照,进行转录组测序,筛选CR70dvs FR70d组、CR200d vs FR200d组、CB70d vs FB70d组和CB200d vs FB200d组4个比较组的DEGs,对DEGs进行功能注释及KEGG信号通路富集分析并构建蛋白互作网络。(剩余26966字)