基于生物信息学筛选肠易激综合征免疫浸润下的染色质调节因子

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[摘要] 目的: 通过生物信息学分析,筛选出肠易激综合征(irritable bowel syndrome,IBS)免疫浸润下的潜在染色质调控因子(chromatin regulators,CRs),并阐述其与免疫细胞、免疫功能之间的联系。方法: 整合CRs文件和IBS基因表达矩阵,进行加权基因共表达分析和差异性分析,取其交集CRs;基于交集CRs,进行蛋白质蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)分析并构建网络图;利用基因表达矩阵进行免疫浸润的提取和量化,分析免疫细胞之间和免疫功能之间的相关性和差异性,并与PPI网络图中的CRs进行相关性分析;构建风险模型,分析与免疫浸润密切相关的CRs的风险概率,从而筛选出潜在的CRs。(剩余18441字)