基于网络药理、分子对接和分子动力学模拟探讨蛇床子治疗牙周炎伴骨质疏松的作用机制

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[摘要] 目的 联合使用网络药理学、分子对接和分子动力学模拟技术探讨蛇床子治疗牙周炎伴骨质疏松的活性成分及潜在靶点，并探讨其可能的作用机制。方法 通过TCMSP 数据库、SwissTargetPrediction 数据库并结合文献报道筛选蛇床子的主要化学成分及作用靶点；采用多种数据库预测牙周炎和骨质疏松的作用靶点；利用Venny 2.1 获取蛇床子与牙周炎和骨质疏松的交集靶点；采用STRING数据库构建交集靶点的蛋白相互作用网络（PPI） 图并使用Cytoscape 3.9.1 软件构建活性成分−交集靶点网络，对其进行拓扑分析筛选关键靶点和核心活性成分；基于Metascape 平台对交集靶点进行基因本体论（GO） 和京都基因与基因组百科全书（KEGG） 富集分析；选取节度点（degree） 值排名前5 位的核心靶点和核心活性成分，使用Discovery Studio 2019 软件对配体和受体进行分子对接，并将结果可视化；使用Gromacs2022.3 进行分子动力学模拟，以评估核心活性成分和关键靶点之间相互作用的稳定性。（剩余21419字）