玉米乙烯响应因子亚家族的生物信息学鉴定与分析

打开文本图片集

摘要： 为了全面了解玉米APETALA2/乙烯响应因子（AP2/ERF）超家族中ERF亚家族成员在玉米生长发育和逆境过程中的作用， 利用生物信息学手段鉴定和分析玉米Zea mays L.B73基因组ERF亚家族成员。 结果表明： 共鉴定到87个ERF基因且不均匀地分布在玉米的10条染色体上， 蛋白序列长度为124～603 aa， 蛋白质分子质量为13.23～65.44 kDa， 理论等电点为4.44～10.84， 亚细胞定位于细胞核； 进化树分析显示，ERF基因被分为5个组， 各组内的基因结构和保守基序的数量、 分布等相似， 但各组之间存在较大的差异， 多数没有内含子， 有内含子的基因占比为20.69%； ERF亚家族成员共有10个保守基序， 其中前2个保守基序最为保守， 且通常以串联方式存在于多数ERF亚家族成员中； 启动子分析显示ZmERF基因含有大量光响应、 激素响应、 胁迫响应和生长发育相关元件， 表明玉米ERF亚家族成员在玉米生长发育及非生物胁迫、 生物胁迫方面发挥作用。（剩余21211字）