贝莱斯芽孢杆菌HN-2次生代谢产物处理下黄单胞菌(Xoo的转录组分析

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摘要:为探究贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezens)菌株 HN-2正丁醇提取物对黄单胞菌(Xoo)的抑菌机制,分别用菌株 HN-2正丁醇提取物和杆菌肽处理12h 后的Xoo进行转录组测序(RNA-seq)并利用 GO 数据库和 KEGG 数据库对转录组数据进行分析。转录组数据分析结果表明,HN-2正丁醇提取物和杆菌肽处理后Xoo菌内均有大量差异表达基因(DEGs),HN-2处理组共得到1512个差异表达基因,其中上调表达基因871个,下调表达基因641个;GO 富集分析发现 HN-2正丁醇提取物处理后,Xoo的差异表达基因主要聚类在代谢过程、细胞组分、大分子复合物、催化活性等方面;KEGG 聚类分析发现 HN-2正丁醇提取物处理后,核糖体途径所包含的差异表达基因数目最多,差异最显著,其余主要参与的代谢途径有淀粉和蔗糖代谢、苯甲酸酯降解、甘油磷脂降解、细菌趋化性等。(剩余14018字)