基于4D label-free 技术的水稻成熟种子蛋白质组学研究

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摘要： 【目的】从蛋白水平揭示水稻种子成熟的分子基础，探究调控水稻种子成熟的关键蛋白和代谢通路。【方法】选用授粉后30 d 的成熟水稻种子，利用4D label-free 定量蛋白质组学进行质谱鉴定，通过生物信息学技术分析蛋白的亚细胞定位、结构域、GO 注释和KEGG 通路注释。【结果】总共鉴定了3 484 个种子成熟期的蛋白，相对分子质量大多在10 000～100 000 之间，主要分布于细胞质、细胞核、叶绿体、线粒体和质膜上；结构域主要涉及蛋白质翻译的RNA 识别基序和蛋白磷酸化修饰的蛋白激酶结构域；GO 分析表明，成熟种子的蛋白主要参与了细胞过程和代谢过程，主要涉及催化活性和结合等功能，大多分布在细胞、细胞组分、细胞器和细胞膜等部位；KEGG 分析发现，蛋白主要富集在核糖体、内质网中的蛋白质加工、氧化磷酸化和糖酵解等途径，推测蛋白质的翻译、加工和能量代谢是水稻种子成熟期的主要分子事件；进一步鉴定了脱落酸（Abscisic acid，ABA） 信号和吲哚乙酸（Indoleacetic acid，IAA） 代谢的相关蛋白，同时也发现了NAC（NAM、ATAF1/2 和 CUC2） 家族的转录因子。（剩余5925字）