基于剪接因子SRSF9 在头颈部鳞状细胞癌中的表达及临床意义的生物信息学分析

打开文本图片集

［摘 要］ 目的：基于生物信息学方法分析富含丝氨酸/精氨酸的剪接因子9（SRSF9） 在头颈部鳞状细胞癌（HNSCC） 中的表达情况、临床意义以及与肿瘤免疫浸润的关系， 并探讨其作用机制。方法：利用癌症基因图谱 （TCGA） 数据库、基因表达综合 （GEO） 数据库中 GSE30784 和GSE13601 数据集、临床蛋白质组学肿瘤分析联盟（CPTAC） 数据库、基因表达交互分析（GEPIA）数据库和Kaplan-Meier plotter 数据库分析SRSF9 在HNSCC 中的表达及与患者临床病理特征和预后的关系；利用cBioPortal 数据库分析SRSF9 基因变异情况；应用ESTIMATE 算法和肿瘤免疫估计资源（TIMER） 数据库评估SRSF9 表达与肿瘤微环境和肿瘤免疫细胞浸润的关系；利用LinkedOmics 数据库分析SRSF9 在HNSCC 中的共表达基因及其调控通路；基于TCGA SpliceSeq 数据库分析HNSCC中SRSF9 调控的可变剪接事件，并对靶基因进行基因本体（GO） 功能富集分析和京都基因与基因组百科全书 （KEGG） 信号通路富集分析。（剩余17502字）