单细胞测序结合机器学习算法揭示心力衰竭病人细胞间通讯及关键调控基因

  • 打印
  • 收藏
收藏成功


打开文本图片集

摘要  目的:基于单细胞测序和机器学习算法构建心力衰竭(HF)的诊断模型,并探索HF病人中细胞间通讯。方法:使用Seurat包对单细胞转录组测序(scRNA-seq)数据质控、降维、聚类和注释。通过AUCell评估各细胞亚群的免疫活性,选择免疫活性最高的细胞亚群进行后续分析。基于批量转录组测序(Bulk RNA-seq)数据,使用limma包筛选差异表达基因并进行基因集富集分析(GSEA)。(剩余16092字)

monitor