基于甲基化捕获联合转录组测序探讨栀子-川芎药对抗动脉粥样硬化的作用机制

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摘要目的：觀察栀子-川芎药对对氧化型低密度脂蛋白（ox-LDL）诱导的RAW264.7泡沫细胞DNA甲基化和转录组表达的作用。方法：细胞毒性试验（CCK-8）法检测不同浓度栀子-川芎冻干粉对RAW 264.7细胞的增殖抑制情况；以ox-LDL处理RAW 264.7细胞48 h形成泡沫细胞，将细胞分为栀子-川芎冻干粉组（80 mg/L ox-LDL、0.3 g/L 栀子-川芎冻干粉干预）、模型组（80 mg/L ox-LDL处理）和空白对照组（未处理）；气相、色谱质谱法（GC-MS）和酶联免疫吸附法（ELISA）分别检测各组总胆固醇（TC）、游离胆固醇（FC）以及炎性因子［肿瘤坏死因子α（TNF-α）、白介素6（IL-6）和细胞间黏附分子1（ICAM-1）］的表达；采用DNA甲基化捕获测序（MC-seq）和转录组测序（RNA-seq）方法检测各组细胞全基因组DNA甲基化和转录组基因表达水平，使用DSS工具分析各组样本间的差异甲基化位点（DMS）和差异表达基因（DEGs），并利用生物信息学方法对差异基因进行京都基因与基因组百科全书（KEGG）和基因本体（GO）富集分析。（剩余15411字）

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