WGCNA联合LASSO-COX方法筛选甲状腺癌预后关键基因及其临床价值分析

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[摘要] 目的 筛选甲状腺癌(thyroid cancer,THCA)的关键预后基因并构建预后预测模型。方法 从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中获取THCA和正常样本的基因表达谱,采用Limma算法筛选THCA组织与正常组织间差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),再进行权重基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)和套索联合COX回归分析(least absolute shrinkage and selection operator regression COX analysis,LASSO-COX)获得与其预后相关基因,然后根据关键基因构建预后预测模型,基于风险评分进行生存分析和受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线分析,最后基于基因表达谱和风险评分进行基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)以评估相关途径和分子机制。(剩余9739字)

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