鼠伤寒沙门菌PipD蛋白结构及抗原表位的生物信息学分析

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摘要：目的  用生物信息学方法预测分析沙门菌PipD蛋白的结构和抗原表位，为沙门菌相关疾病的诊疗和疫苗的研发提供理论依据。方法  通过NCBI数据库获得沙门菌典型致病血清型：鼠伤寒沙门菌（Salmonella typhimurium）ATCC 14028S标准菌株STM14_1240基因的核苷酸序列及其编码蛋白PipD 的氨基酸序列，运用ProtParam、ProtScale、SignalP 4.1 Server、TMHMM Serverv.2.0、Netphos 3.1 Server、NetNGlyc-1.0、NCBI BLAST、SOMPA、SWISSMODEL、ABCpred、SYFPEITHI和UniProt等生物信息学工具分别对鼠伤寒沙门菌PipD蛋白的理化性质、亲疏水特性、信号肽、跨膜区、磷酸化位点、糖基化位点、结构域、二级结构、三级结构、B细胞抗原表位、T细胞抗原表位及蛋白同源性进行预测分析。（剩余10827字）