基于生物信息学方法双芯片联合分析阿尔茨海默病海马相关差异基因的研究

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【摘要】 目的 利用生物信息学筛选阿尔茨海默病（Alzheimer’s disease，AD）海马组织的差异表达基因（DEGs），分析DEGs的生物学功能和信号通路，为AD的诊断、治疗靶点的筛选提供参考。方法 利用GEO（gene expression omnibus）数据库下载基因芯片GSE48350、GSE5281，使用数据库GEO2R工具在线分析，以P<0.05，|logFC>1|为条件筛选差异基因，筛选出与AD海马组织相关的DEGs，通过制作维恩图取交集获得两个芯片共同DEGs；使用R语言enrichGO函数对筛选出来的DEGs进行基因本体论（GO）功能富集分析；在Metascape网站做京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路分析；使用STRING数据库和Cytoscape3.9.1软件进行蛋白-蛋白相互作用（PPI）网络分析。（剩余10874字）