胃癌预后相关基因的生物信息学鉴定

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[摘要]目的筛选和鉴定胃癌预后相关的关键基因和通路,探讨胃癌发生发展的机制。方法从基因表达数据库中下载胃癌基因表达谱芯片数据集(GSE2685、GSE29272),通过在线分析工具GEO2R对胃癌组织和正常组织中的差异表达基因(DEGs)进行筛选;通过基因功能注释数据库(DAVID)进行功能富集分析;运用交互基因检索工具数据库(STRING)和Cytoscape软件分析DEGs可编码蛋白之间的相互作用网络;利用在线生存分析数据库(KM-plotter)分析核心候选基因和胃癌患者预后的相关性;通过免疫组化染色验证候选基因在胃癌组织中表达情况,并分析与胃癌临床病理参数及预后的相关性;采用Cox风险回归模型分析患者总体生存率的影响因素。(剩余11852字)