人参健脾丸与人参归脾丸均属补益药。两者均含人参、茯苓、白术、黄芪以益气健脾；含木香理气健脾、调理中焦气机；含酸枣仁远志安神定志；含当归活血养血。于是，有些患者就认为两者都是健脾的，功效应该也是一样的。
其实，人参健脾丸还含有山药、陈皮、砂仁加强健脾和胃的作用；人参归脾丸另有龙眼肉、炙甘草补血和营。另外，同样药物的用量也有所不同:人参健脾丸重用黄芪、山药，意在健脾益气；人参归脾丸重用当归、人参养血益气。
由于其用药的不同决定上述两种药的功用也不同，人参健脾丸具有健脾益气、和胃止泻的功效，主要用于脾胃虚弱引起的恶心呕吐、腹痛便溏、不思饮食、体弱倦怠。人参归脾丸具有益气补血、健脾养心的功效，主要用于心脾两虚，气血不足所致的心悸，失眠健忘，食少体倦，面色萎黄所致的便血、崩漏、带下诸症。所以，人参健脾丸偏重于健脾理气，而人参归脾丸偏重于补气养血。
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